横琴作为连接粤港澳的枢纽，是推动粤港澳建设紧密联系的关键。因此国家在横琴以及大湾区出台了一系列税收优惠政策。

以下从企业所得税、个人所得税、关税三个税收优惠政策来分析在横琴注册公司的优势。

企业所得税

在该区域里符合条件的产业企业相对于内地企业所得税25%的税率减按15%征收企业所得税；

对企业符合条件的资本性支出，允许在支出发生当期一次性税前扣除或加速折旧和摊销；

对在合作区设立的旅游业、现代服务业、高新技术产业企业新增境外直接投资取得的所得，免征企业所得税。

除此之外，在澳门的中医药以及食品企业等可在横琴贴字。

个人所得税

对于在横琴以及粤港澳合作区工作的境内外高端人才和紧缺人才，其个人所得税负超过15%的部分予以免征；

对在合作区工作的澳门居民，其个人所得税负超过澳门税负的部分予以免征。

关税

从内地经“二线”（香港、澳门）进入合作区的有关货物视同出口，按现行税收政策规定实行增值税和消费税退税；